為了讓離心噴霧干燥塔體及其管道和**與成品接觸的部件的清潔，從而獲得良好的產品、有規則的清洗設備是很重要一個環節。
當替換產品時，或是設備已經停24小時以上而未清洗的，應作一次詳細的清洗。
干洗：用刷子、掃帚、吸塵器清掃。 濕洗：用60-80℃的熱水進行清洗。
酸洗：將硝酸（HNO3）配成1-2%濃度的溶液，加熱溫度不超過95℃進行洗滌，然后用水清洗。
堿洗：氫氧化鈉（NaOH）配成0.5-1%濃度的溶液，加熱到60-80℃進行洗滌，然后用水清洗。
當進行濕洗和化學洗滌后，應將設備和各部件安裝好，進行高溫消毒，時間15-30分鐘。
在本設備清洗時，應注意不能用氯及其化合物洗滌。
空氣過濾器的清洗，應按周圍環境條件，即空氣中含塵量的高低而定，一般含量高的3-6星期清洗一次，含塵量低的6-8星期清洗1次。